Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn4E9PX29 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn4E9PX29 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn4E9PX29 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn4E9PX29 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn4E9PX29 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn4E9PX29 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn4E9PX29 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn4E9PX29 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms