Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl3lE9PWZ3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl3lE9PWZ3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl3lE9PWZ3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpl3lE9PWZ3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms