Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms