Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc62E9PVD1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms