Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim5E9PV98 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trim5E9PV98 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trim5E9PV98 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trim5E9PV98 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim5E9PV98 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim5E9PV98 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim5E9PV98 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim5E9PV98 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim5E9PV98 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim5E9PV98 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms