Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Clca3bE9PUL3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca3bE9PUL3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca3bE9PUL3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca3bE9PUL3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms