Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
5430403G16RikD3Z5L4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
5430403G16RikD3Z5L4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5430403G16RikD3Z5L4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
5430403G16RikD3Z5L4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
5430403G16RikD3Z5L4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430403G16RikD3Z5L4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
5430403G16RikD3Z5L4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430403G16RikD3Z5L4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430403G16RikD3Z5L4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430403G16RikD3Z5L4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms