Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9630041A04RikD3Z3U4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9630041A04RikD3Z3U4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms