Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3676D3Z236 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3676D3Z236 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms