Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930467E23RikD3Z1P8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms