Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SafbD3YXK2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SafbD3YXK2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SafbD3YXK2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SafbD3YXK2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SafbD3YXK2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SafbD3YXK2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SafbD3YXK2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SafbD3YXK2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SafbD3YXK2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms