Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms