Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo5D3YW29 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms