Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna7C0LLJ0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms