Protein–RNA interactions for Protein: C0HKG6

Rnaset2b, Ribonuclease T2-B, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaset2bC0HKG6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaset2bC0HKG6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnaset2bC0HKG6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms