Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms