Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20547B8JJN0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Gm20547B8JJN0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20547B8JJN0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20547B8JJN0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Gm20547B8JJN0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20547B8JJN0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20547B8JJN0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20547B8JJN0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20547B8JJN0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20547B8JJN0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20547B8JJN0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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Gm20547B8JJN0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20547B8JJN0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20547B8JJN0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20547B8JJN0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20547B8JJN0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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