Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apol6B7ZC55 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol6B7ZC55 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms