Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms