Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc11B2RXC1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms