Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cspp1B2RX88 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms