Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Siah3B2RWG3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms