Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700018F24RikB2RW27 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700018F24RikB2RW27 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700018F24RikB2RW27 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700018F24RikB2RW27 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
1700018F24RikB2RW27 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700018F24RikB2RW27 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700018F24RikB2RW27 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700018F24RikB2RW27 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700018F24RikB2RW27 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700018F24RikB2RW27 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700018F24RikB2RW27 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700018F24RikB2RW27 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms