Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd34aB2RW11 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd34aB2RW11 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd34aB2RW11 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd34aB2RW11 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms