Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms