Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AU015836B2RUM3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms