Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc22a28B2RT89 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms