Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed5B2RPU8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms