Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms