Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2012B1B0R1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2012B1B0R1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms