Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Tmem235B1AQL3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Tmem235B1AQL3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tmem235B1AQL3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tmem235B1AQL3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Tmem235B1AQL3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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Tmem235B1AQL3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem235B1AQL3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Tmem235B1AQL3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem235B1AQL3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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