Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skint2A7XUX6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skint2A7XUX6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint2A7XUX6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint2A7XUX6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms