Protein–RNA interactions for Protein: A6H619

Phrf1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phrf1A6H619 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phrf1A6H619 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phrf1A6H619 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms