Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms