Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms