Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Upf2A2AT37 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms