Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms