Protein–RNA interactions for Protein: A2ARK0

Fam83c, Protein FAM83C, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83cA2ARK0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam83cA2ARK0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam83cA2ARK0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms