Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms