Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms