Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FocadA2AKG8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FocadA2AKG8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FocadA2AKG8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FocadA2AKG8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FocadA2AKG8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FocadA2AKG8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FocadA2AKG8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FocadA2AKG8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FocadA2AKG8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FocadA2AKG8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms