Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frmpd4A2AFR3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms