Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms