Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms