Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVU1

Gm7298, Predicted gene 7298, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7298A0A0N4SVU1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm7298A0A0N4SVU1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm7298A0A0N4SVU1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm7298A0A0N4SVU1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm7298A0A0N4SVU1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm7298A0A0N4SVU1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm7298A0A0N4SVU1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms