Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUK1

AW822073, Expressed sequence AW822073, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW822073A0A0N4SUK1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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AW822073A0A0N4SUK1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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AW822073A0A0N4SUK1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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AW822073A0A0N4SUK1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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AW822073A0A0N4SUK1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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AW822073A0A0N4SUK1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AW822073A0A0N4SUK1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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AW822073A0A0N4SUK1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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AW822073A0A0N4SUK1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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AW822073A0A0N4SUK1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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AW822073A0A0N4SUK1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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AW822073A0A0N4SUK1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AW822073A0A0N4SUK1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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AW822073A0A0N4SUK1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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AW822073A0A0N4SUK1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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AW822073A0A0N4SUK1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms