Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbc2A0A075B5J4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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