Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnft1Q9DCN7 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnft1Q9DCN7 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnft1Q9DCN7 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnft1Q9DCN7 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnft1Q9DCN7 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnft1Q9DCN7 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rnft1Q9DCN7 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rnft1Q9DCN7 Gm14061-201ENSMUST00000155923 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rnft1Q9DCN7 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rnft1Q9DCN7 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Rnft1Q9DCN7 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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