Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Creb5-202ENSMUST00000203487 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Dhx30-204ENSMUST00000196171 3885 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Cd101-201ENSMUST00000147399 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Btn2a2-203ENSMUST00000110433 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Filip1-201ENSMUST00000093811 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Ece2-207ENSMUST00000079600 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Cd22-201ENSMUST00000019248 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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PtprtQ99M80 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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PtprtQ99M80 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Ube4bos1-201ENSMUST00000141259 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Zfp677-202ENSMUST00000162659 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Arhgef3-201ENSMUST00000049206 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Aldh2-201ENSMUST00000031411 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms