Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Slc16a4-202ENSMUST00000106723 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Sidt2-202ENSMUST00000114573 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Zmat3-203ENSMUST00000168566 7672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Phf8-206ENSMUST00000112670 3484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Glb1l2-202ENSMUST00000066560 3688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Atg14-201ENSMUST00000042988 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Rasgef1b-207ENSMUST00000166484 1296 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm21784-201ENSMUST00000186639 694 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms